RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TEX29Q8N6K0 151 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF527Q8NB42 609 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CDKL2Q92772 493 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 DOK1Q99704 481 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PCTPQ9UKL6 214 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TRAV20A0A0B4J274 112 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 POM121CA8CG34 1229 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 C17orf78Q8N4C9 275 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 RNF217Q8TC41 542 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SLITRK2Q9H156 845 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.33■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF716A6NP11 495 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 KCNK2O95069 426 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 NKX2-2O95096 273 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 TFP02787 698 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CRABP2P29373 138 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 DIO1P49895 249 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CCNJQ5T5M9 372 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 GPR119Q8TDV5 335 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 DNAJA3Q96EY1 480 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 NTN4Q9HB63 628 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.32■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SLITRK5O94991 958 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 WNT11O96014 354 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CRYAAP02489 173 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 ADRA2AP08913 450 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 TSPAN8P19075 237 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 MAP3K8P41279 467 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 IL13RA1P78552 427 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 HIKESHIQ53FT3 197 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA21Q7Z572 469 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 UPB1Q9UBR1 384 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SNX12Q9UMY4 172 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SNX6Q9UNH7 406 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1W2PQD3 144 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM129A0AVI4 362 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 E7ESA3 106 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 ACP2P11117 423 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 PRTN3P24158 256 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 COL8A2P25067 703 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 P2RX1P51575 399 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 LMO4P61968 165 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CDK20Q8IZL9 346 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 NANPQ8TBE9 248 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 APIPQ96GX9 242 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 FAM159BA6NKW6 160 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 TTC36A6NLP5 189 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 SULT2B1O00204 365 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 TP73O15350 636 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 PRSS23O95084 383 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 DDCP20711 480 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 MDKP21741 143 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 CALCRP30988 508 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 THBS4P35443 961 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 PRKAG1P54619 331 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 C2orf80Q0P641 193 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM4-202ENST00000547188 PDK3Q15120 406 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms