RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXC12P31275 282 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ARRB2P32121 409 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC1A3P43003 542 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 AQP5P55064 265 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35A1P78382 337 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TGFBR3Q03167 851 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35B4Q969S0 331 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MUCL1Q96DR8 90 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SIRPAP78324 504 aa5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXF1Q12946 379 aa5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SKP2Q13309 424 aa5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 KEAP1Q14145 624 aa5.03□□□□□ -1.6
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