RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FZD7O75084 574 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SULT1C4O75897 302 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A10O95528 541 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RAB36O95755 333 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LALBAP00709 142 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HTR1FP30939 366 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IFNA8P32881 189 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HOXD12P35452 270 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CD79BP40259 229 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 MTNR1AP48039 350 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GSK3AP49840 483 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DLX5P56178 289 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IFITM3Q01628 133 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 TMED1Q13445 227 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SPHARQ15513 63 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SNAPC1Q16533 368 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NIPAL3Q6P499 406 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DPH1Q9BZG8 443 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.18□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 OR6C76A6NM76 312 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 B4DXG7 233 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN25C9JDP6 229 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 J3QRK9 145 aa5.17□□□□□ -1.58
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