RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SPRED1Q7Z699 444 aa13.58□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 SYPL1Q16563 259 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MED20Q9H944 212 aa13.57□□□□□ -0.24
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PTPRU-204ENST00000428026 RAB5CP51148 216 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 RAB28P51157 221 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 DCST2Q5T1A1 773 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CCNJQ5T5M9 372 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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