RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ALOX5P09917 674 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHA1P21709 976 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 IVDP26440 423 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEA8P43361 318 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PRIM2P49643 509 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB8P50452 374 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ARFIP2P53365 341 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF3Q13114 568 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CBFBQ13951 182 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRA6Q16445 453 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 APOOLQ6UXV4 268 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF786Q8N393 782 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SVOPLQ8N434 492 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 COX18Q8N8Q8 333 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C3Q8NH37 302 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 POC1BQ8TC44 478 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3R3Q92569 461 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5B2Q96R09 309 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 EQTNQ9NQ60 294 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MED29Q9NX70 200 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MALT1Q9UDY8 824 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MOKQ9UQ07 419 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PR80 420 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 POM121CA8CG34 1229 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 C9JVG2 144 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC188H7C350 402 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 DNPH1O43598 174 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRA1O75019 489 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PIAS1O75925 651 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT33AO76009 404 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPP00491 289 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-9P01782 118 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MSMBP08118 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT16P08779 473 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4A8P0C604 315 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PGCP20142 388 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAG1P54619 331 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 IMPG1Q17R60 797 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP43Q8NFH3 380 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL6Q8TCB7 284 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 JADE3Q92613 823 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS11Q9H270 941 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PLK3Q9H4B4 646 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCE1Q9P212 2302 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JMP0 313 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0X1KG70 313 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PNR3 127 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MANBAO00462 879 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD28O15084 1053 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK2O95069 426 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 HKR1P10072 659 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TFPIP10646 304 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCAP17252 672 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 TAC1P20366 129 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 SHC1P29353 583 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 MPGP29372 298 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 PAFAH1B1P43034 410 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms