RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A0G2JPF8	293 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TNFSF11	O14788	317 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ARAF	P10398	606 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	BMP2	P12643	396 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF17	P17021	662 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	AGA	P20933	346 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	AQP1	P29972	269 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	SESN3	P58005	492 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CDK6	Q00534	326 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FOXF2	Q12947	444 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ART3	Q13508	389 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A0J9YW62	118 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	C7orf72	A4D263	438 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	MRAS	O14807	208 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	FRS3	O43559	492 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CXCL13	O43927	109 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	SNX3	O60493	162 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	PGM3	O95394	542 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	IL2RA	P01589	272 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	NID1	P14543	1247 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	GPX2	P18283	190 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	PGC	P20142	388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	BMP5	P22003	454 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF136	P52737	540 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	RAC1	P63000	192 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	SCARB2	Q14108	478 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	GNA13	Q14344	377 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	ADRM1	Q16186	407 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	SGCB	Q16585	318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1W2PNR3	127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	FXYD1	O00168	92 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CCDC22	O60826	627 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CCNA2	P20248	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	ME2	P23368	584 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	TIMP3	P35625	211 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC6A8	P48029	635 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	MERTK	Q12866	999 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	PON3	Q15166	354 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	HSPB2	Q16082	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARID1B-222	ENST00000637003	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23

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