RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	APC	P25054	2843 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PP18	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	DVL2	O14641	736 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TNFSF11	O14788	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CXCL13	O43927	109 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYP7B1	O75881	506 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	IL18BP	O95998	194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	NR2F1	P10589	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	BMP2	P12643	396 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADH6	P28332	368 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SESN3	P58005	492 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	KRTAP10-9	P60411	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	DSTN	P60981	165 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CBFB	Q13951	182 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	PON3	Q15166	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	QPRT	Q15274	297 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	VRK2	Q86Y07	508 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAL2	Q969L2	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	STARD4	Q96DR4	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	HHATL	Q9HCP6	504 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	RLIM	Q9NVW2	624 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAST4	O15021	2626 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PNV4	684 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	AP3D1	O14617	1153 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	BCHE	P06276	602 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SFTPD	P35247	375 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	OPRM1	P35372	400 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAGEA8	P43361	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCR4	P51679	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	VWA1	Q6PCB0	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	OSTF1	Q92882	214 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM19	Q96HH6	336 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	GMEB1	Q9Y692	573 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDZD2	O15018	2839 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	LRBA	P50851	2863 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	NOTCH2	Q04721	2471 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112		A8MXE2	369 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	FBP2	O00757	339 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	CGA	P01215	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	KLK2	P20151	261 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ELK4	P28324	431 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	UQCRC1	P31930	480 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	RYK	P34925	604 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ASCL1	P50553	236 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ARFIP2	P53365	341 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SELPLG	Q14242	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADRM1	Q16186	407 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	SGCB	Q16585	318 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RASGRF1-208	ENST00000561112	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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