RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 E9PBE3 544 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 EFNA2O43921 213 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 AGR2O95994 175 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 CSTAP01040 98 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PRKCAP17252 672 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SHC1P29353 583 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SLC7A1P30825 629 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PCYT1AP49585 367 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 UFM1P61960 85 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PHC1P78364 1004 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 QPRTQ15274 297 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SPANXN4Q5MJ08 99 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ATG16L1Q676U5 607 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ZNF563Q8TA94 476 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TMEM234Q8WY98 164 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TESCQ96BS2 214 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 OR52E6Q96RD3 313 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PANX1Q96RD7 426 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB18Q99592 522 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 LAT2Q9GZY6 243 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ARID1AO14497 2285 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 HDAC3O15379 428 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SCN2BO60939 215 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 UGT2B17O75795 530 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PRKD3O94806 890 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ATE1O95260 518 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TFPIP10646 304 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PGCP20142 388 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 KLK2P20151 261 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ELK4P28324 431 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 EPHA3P29320 983 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 RYKP34925 604 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ADAM8P78325 824 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 HPCAP84074 193 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SELENBP1Q13228 472 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 CASP8Q14790 479 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 GUSBP1Q15486 140 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ZNF141Q15928 474 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 OGFOD2Q6N063 350 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 FCRLAQ7L513 359 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ZFP90Q8TF47 636 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ROPN1LQ96C74 230 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 TEX37Q96LM6 180 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 OR5B2Q96R09 309 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 DLL4Q9NR61 685 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 HAO1Q9UJM8 370 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 WDR45Q9Y484 360 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PNR3 127 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 CCDC154A6NI56 674 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 C9JVG2 144 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 SDHDO14521 159 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD28O15084 1053 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 DIAPH2O60879 1101 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 GSNP06396 782 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PGRP06401 933 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 YES1P07947 543 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 PPP3CBP16298 524 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 ENPP1P22413 925 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 CRYGSP22914 178 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-222ENST00000540445 AGTR1P30556 359 aa8.04□□□□□ -1.12
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