RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	GUSB	P08236	651 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	NID1	P14543	1247 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTSS	P25774	331 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELK4	P28324	431 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP10-9	P60411	292 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DSTN	P60981	165 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIRPA	P78324	504 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SELPLG	Q14242	412 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GUSBP1	Q15486	140 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGN	Q15493	299 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	VRK2	Q86Y07	508 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM19	Q96HH6	336 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAT2	Q9GZY6	243 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	JKAMP	Q9P055	326 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGAP5	A6NIR3	686 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959		H3BNH8	94 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01387	J3KSC0	135 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFPT	P0C1Z6	253 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	NR2F1	P10589	423 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	UQCRC1	P31930	480 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCKAR	P32238	428 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RYK	P34925	604 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAC1	P63000	192 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ10	P78508	379 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CBFB	Q13951	182 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	LUZP2	Q86TE4	346 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	COMTD1	Q86VU5	262 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHL15	Q96M94	604 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TM9SF2	Q99805	663 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF122	Q9H9V4	155 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RLIM	Q9NVW2	624 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	APC	P25054	2843 aa		9.96	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PNR3	127 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLIC1	O00299	241 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBP2	O00757	339 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAMDEC1	O15204	470 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL18BP	O95998	194 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMP2	P12643	396 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	SESN3	P58005	492 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	SELENBP1	Q13228	472 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	9.96	□□□□□ -0.82	1e-11	■■■■□ 21.3
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	LILRA2	Q8N149	483 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	STARD4	Q96DR4	205 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED4	Q9NPJ6	270 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	GALNT8	Q9NY28	637 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIPT1	Q9Y234	373 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF175	Q9Y473	711 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PP18	115 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRS3	O43559	492 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	GKN3P	P0CG01	181 aa		9.95	□□□□□ -0.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARAF	P10398	606 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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