RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022356.11

Usp54-201, Transcript of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usp54, Length 6,580 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54-201ENSMUST00000022356 Rab39aQ8BHD0 217 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vmn1r218Q8R261 298 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr63Q8VBW9 316 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr281Q8VET6 311 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 SharpinQ91WA6 380 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mrm1Q99J25 320 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Acss1Q99NB1 682 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cxxc1Q9CWW7 660 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Prl8a1Q9DAV8 240 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Sorcs2Q9EPR5 1159 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 IL36RNQ9QYY1 156 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fbxw27A0A1D5RLF0 466 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pramef25A2ASI9 494 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Phf11A6H5X4 337 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm10376D3YXI8 184 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm3676D3Z236 184 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm10375L7N286 184 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm3573L7N292 184 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 TertO70372 1122 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 ApoeP08226 311 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tead1P30051 426 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Eci1P42125 289 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fgf11P70378 225 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 SctQ08535 133 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Trim63Q38HM4 350 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Man2a2Q8BRK9 1152 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slc35a3Q8R1T4 326 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gstt3Q99L20 241 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Clvs1Q9D4C9 354 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tuba8Q9JJZ2 449 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 ClcnkbQ9WUB6 687 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Net1Q9Z206 595 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 CorinQ9Z319 1113 aa7.56□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Galntl6E5D8G1 601 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vmn2r110E9PWD5 858 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm20441G3UYJ7 252 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nfatc1O88942 717 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Il10P18893 178 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gpat2Q14DK4 801 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Apcdd1Q3U128 514 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr32Q7TQZ0 308 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cml2Q8CHQ9 238 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr570Q8VH12 312 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fkbp11Q9D1M7 201 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Efhc1Q9D9T8 648 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Myh4Q5SX39 1939 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Obp1bA2AEP0 171 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm14743A2BHD2 171 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1511E9PWU0 318 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Macc1E9PXX8 851 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1510E9PZZ6 318 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cacng1O70578 223 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 HexbP20060 536 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 GifP52787 417 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 CtscP97821 462 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nme2Q01768 152 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Scgb1a1Q06318 96 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lingo2Q3URE9 606 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr366Q7TRY4 309 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Enkd1Q7TSV9 346 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Klhl42Q8BFQ9 493 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pck2Q8BH04 640 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ston2Q8BZ60 895 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm13199Q8C8E0 125 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Med9Q8VCS6 142 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1389Q8VGX0 311 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr713Q920G5 324 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dusp21Q9D9D8 189 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Phospho2Q9D9M5 241 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Trhr2Q9ERT2 382 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 RgrQ9Z2B3 291 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 PappaQ8R4K8 1624 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tarm1B6A8R8 288 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Zfp282E9PVC2 666 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Emp3O35912 163 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr125Q14AJ9 320 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 CblbQ3TTA7 982 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tex52Q3TTI8 308 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Q3U1D9 316 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Trav6-2Q5R1I4 113 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gstt2Q61133 244 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Itih2Q61703 946 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Kmt5cQ6Q783 468 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Aqp12Q8CHJ2 290 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1033Q8VFK5 310 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dhrs4Q99LB2 279 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Klk10Q99M20 278 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tex13bQ99MW5 186 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fam122cQ9D5J5 180 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lpar3Q9EQ31 354 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ildr2B5TVM2 661 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 EomesO54839 707 aa7.55□□□□□ -1.2
Usp54-201ENSMUST00000022356 Prkar2aP12367 401 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms