RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619314.1

GABPB1-AS1-206, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

Gene GABPB1-AS1, Length 1,076 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PCNX3Q9H6A9 2034 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 A0A0G2JPF8 293 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HSPB2A8KAH6 182 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 H0Y3Z8 333 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CCDC22O60826 627 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CLDN1O95832 211 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PGM1P36871 562 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SKP2Q13309 424 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 HSPB2Q16082 182 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RNF6Q9Y252 685 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TEX15Q9BXT5 2789 aa20.31■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 OIP5O43482 229 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GMFGO60234 142 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NUDT14O95848 222 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NPPAP01160 153 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 LSP1P33241 339 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RAC1P63000 192 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SRYQ05066 204 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RETREG3Q86VR2 466 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CGREF1Q99674 301 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RUBCNLQ9H714 662 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.3■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GMNCA6NCL1 334 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 IL2RAP01589 272 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BCHEP06276 602 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NID1P14543 1247 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 IL7RP16871 459 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PGCP20142 388 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ELK4P28324 431 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SLC6A8P48029 635 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 NFYCQ13952 458 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 SPATA21Q7Z572 469 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 POC1BQ8TC44 478 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TMEM234Q8WY98 164 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ST8SIA1Q92185 356 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 WNT2BQ93097 391 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TMEM19Q96HH6 336 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TRIB1Q96RU8 372 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 IFT52Q9Y366 437 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.29■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 A0A0G2JNJ9 132 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 A1L4Q6 167 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 H3BML4 177 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 THBS1P07996 1170 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 ARAFP10398 606 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 DLX5P56178 289 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 BBS10Q8TAM1 723 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 RNF145Q96MT1 663 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 TM9SF2Q99805 663 aa20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GABPB1-AS1-206ENST00000619314 CHST11Q9NPF2 352 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms