RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aldoart2A6ZI47 364 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GfapP03995 430 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dcst1Q059Y8 732 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DcstampQ7TNJ0 470 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gramd1bQ80TI0 738 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5111Q8C9M4 190 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AcmsdQ8R519 336 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr449Q8VGW8 311 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr643Q8VGY1 314 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ints11Q9CWS4 600 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dazap2Q9DCP9 168 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm11983V9GXS8 105 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vps13cQ8BX70 3748 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp738B8JJX8 793 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Macc1E9PXX8 851 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8926L7MUE8 181 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psmd3P14685 530 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PahP16331 453 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atf4Q06507 349 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BC080695Q66JY9 481 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zpbp2Q6X786 326 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hmbox1Q8BJA3 419 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abhd3Q91ZH7 411 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam162aQ9D6U8 155 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex29Q9DA77 186 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcb10Q9JI39 715 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DguokQ9QX60 277 aa27.89■■■□□ 2.06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp600A2A7V0 737 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Muc3E9PWP7 378 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tbc1d10aP58802 500 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ctu2Q3U308 514 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc22a23Q3UHH2 689 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 OclnQ61146 521 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DmknQ6P253 517 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1167Q7TR26 316 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dppa4Q8CCG4 296 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl25Q8R2P1 589 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cavin3Q91VJ2 260 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Acss2Q9QXG4 701 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tyk2Q9R117 1184 aa27.89■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chd8Q09XV5 2582 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1338A2ACY7 313 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Obp2bA2BHR0 176 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TagapB2RWW0 714 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem92B7ZWI3 162 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01680 129 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ces2fQ08ED5 561 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rcor3Q6PGA0 451 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ces2cQ91WG0 561 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9D3J9 298 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cers4Q9D6J1 393 aa27.88■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm6710A2ART0 554 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pdzd8B9EJ80 1147 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ulk1O70405 1051 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vti1bO88384 232 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr325Q5NCD2 326 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cyb561a3Q6P1H1 242 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PimregQ8BFY7 231 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MkxQ8BIA3 353 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q8BPC6 396 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prps1l1Q8C5R8 318 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Snapc1Q8K0S9 389 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr109Q8VG96 314 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Asb17Q8VHP9 295 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrgpra3Q91WW3 302 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Acy3Q91XE4 318 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 OgfrQ99PG2 633 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Heatr5bQ8C547 2070 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa27.87■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc25a25A2ASZ8 469 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hcrtr2P58308 460 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CtseP70269 397 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ptchd3Q0EEE2 906 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nxf3Q4ZGD9 553 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr341Q8VGK9 313 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P2rx4Q9JJX6 388 aa27.86■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp969A2ART2 485 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp973A2BE20 318 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mybpc1D3YU50 1127 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cd209fD3Z1H5 274 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r38G3UYA8 861 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 LipcP27656 510 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nat3P50296 290 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mfap2P55002 183 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ctf2P83714 204 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Apoa1Q00623 264 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grxcr2Q3TYR5 254 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grb10Q60760 621 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ubash3bQ8BGG7 638 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mfsd11Q8BJ51 449 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam46bQ8C152 427 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmprss3Q8K1T0 453 aa27.85■■■□□ 2.05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nkd1Q99MH6 471 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.6 ms