RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mansc4Q3UU94 337 aa20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gramd1cQ8CI52 457 aa20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph9Q9D9V4 276 aa20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pole3Q9JKP7 145 aa20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtgesQ9JM51 153 aa20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa20.62■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr228A0A1L1SR98 313 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1056A2AVY0 313 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cd101A8E0Y8 1033 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8229K7N749 213 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alox12eP55249 662 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk10Q3UMM4 360 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EgflamQ4VBE4 1017 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifngr2Q63953 332 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr298Q7TS06 332 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdh19Q80TF3 1145 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb46Q8BID6 600 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf770Q8BIQ8 705 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Etv3Q8R4Z4 513 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arpc5lQ9D898 153 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ap3s1Q9DCR2 193 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plscr3Q9JIZ9 296 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp937A2ANU7 503 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hoxb3P09026 433 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Thbs2Q03350 1172 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sema3gQ4LFA9 780 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc22a29Q8BWG6 551 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HpgdQ8VCC1 269 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim3Q9R1R2 744 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccl27Q9Z1X0 120 aa20.61■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm13124A2A752 406 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1076A2AK60 313 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr601A2RS33 314 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr519K7N645 319 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17026K7N6Z0 213 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bcl2a1dO55179 172 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gja4P28235 333 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptpn18Q61152 453 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Heatr5bQ8C547 2070 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncr1Q8C567 325 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr881Q8VF63 314 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pskh1Q91YA2 424 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lman2Q9DBH5 358 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lypd2Q9DD23 127 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nfatc1O88942 717 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C130050O18RikQ497Y9 356 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CishQ62225 257 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smad2Q62432 467 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp3r1Q63810 170 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpinb9fQ80UK5 377 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SnupnQ80W37 358 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssuh2Q8C3L1 340 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr771Q8VFH6 317 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sertad3Q9ERC3 197 aa20.6■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Skint9A7TZG3 319 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm8374L7N2A9 172 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sp3O70494 783 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ctbp2P56546 445 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr2cP97760 275 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Teddm2Q208S0 260 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taar7bQ5QD11 358 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BocQ6AZB0 1110 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Methig1Q76I26 264 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScocQ78YZ6 125 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rims3Q80U57 307 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc35f1Q8BGK5 408 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc25a12Q8BH59 677 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpr152Q8BXS7 511 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp709Q8VC29 727 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abhd17cQ8VCV1 320 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rgs5O08850 181 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dcst1Q059Y8 732 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E2f1Q61501 430 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nox3Q672J9 568 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tas2r3Q7TQA7 316 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sgpp2Q810K3 354 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nceh1Q8BLF1 408 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc26a9Q8BU91 790 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf222Q8CEF8 211 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rdh1Q8CGV4 317 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tlr1Q9EPQ1 795 aa20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf217D3YYI7 515 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gsg1lD3Z7H4 322 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arl9F7BE40 171 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn1r13G5E8I3 300 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 S100a2J3QMC7 104 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NlkO54949 527 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AurkcO88445 282 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cd14P10810 366 aa20.58■□□□□ 0.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Csn1s1P19228 313 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.2 ms