Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,44■■■■□ 3,58
Rsph9Q9D9V4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Rsph9Q9D9V4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Rsph9Q9D9V4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,76■■■□□ 2,83
Rsph9Q9D9V4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Rsph9Q9D9V4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Rsph9Q9D9V4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
Rsph9Q9D9V4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Rsph9Q9D9V4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Rsph9Q9D9V4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Rsph9Q9D9V4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rsph9Q9D9V4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Rsph9Q9D9V4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Rsph9Q9D9V4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Rsph9Q9D9V4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Rsph9Q9D9V4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Rsph9Q9D9V4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Rsph9Q9D9V4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Rsph9Q9D9V4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Rsph9Q9D9V4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Rsph9Q9D9V4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Rsph9Q9D9V4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Rsph9Q9D9V4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Rsph9Q9D9V4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rsph9Q9D9V4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rsph9Q9D9V4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rsph9Q9D9V4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rsph9Q9D9V4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rsph9Q9D9V4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Rsph9Q9D9V4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rsph9Q9D9V4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rsph9Q9D9V4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Rsph9Q9D9V4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rsph9Q9D9V4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Rsph9Q9D9V4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rsph9Q9D9V4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Rsph9Q9D9V4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rsph9Q9D9V4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Rsph9Q9D9V4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rsph9Q9D9V4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rsph9Q9D9V4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rsph9Q9D9V4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Rsph9Q9D9V4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rsph9Q9D9V4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rsph9Q9D9V4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rsph9Q9D9V4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Rsph9Q9D9V4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rsph9Q9D9V4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rsph9Q9D9V4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rsph9Q9D9V4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rsph9Q9D9V4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rsph9Q9D9V4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rsph9Q9D9V4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rsph9Q9D9V4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rsph9Q9D9V4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rsph9Q9D9V4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Rsph9Q9D9V4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Rsph9Q9D9V4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Rsph9Q9D9V4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rsph9Q9D9V4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Rsph9Q9D9V4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rsph9Q9D9V4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rsph9Q9D9V4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Rsph9Q9D9V4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rsph9Q9D9V4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Rsph9Q9D9V4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Rsph9Q9D9V4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rsph9Q9D9V4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rsph9Q9D9V4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rsph9Q9D9V4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Rsph9Q9D9V4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rsph9Q9D9V4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Rsph9Q9D9V4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rsph9Q9D9V4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rsph9Q9D9V4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Rsph9Q9D9V4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rsph9Q9D9V4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rsph9Q9D9V4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rsph9Q9D9V4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rsph9Q9D9V4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rsph9Q9D9V4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rsph9Q9D9V4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rsph9Q9D9V4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rsph9Q9D9V4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rsph9Q9D9V4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,51■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rsph9Q9D9V4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rsph9Q9D9V4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rsph9Q9D9V4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rsph9Q9D9V4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rsph9Q9D9V4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms