RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 S100A2P29034 98 aa18.94■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 ACTG1P63261 375 aa18.94■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 CD300LFQ8TDQ1 290 aa18.93■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 AIFM1O95831 613 aa18.93■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa18.92■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 ULBP2Q9BZM5 246 aa18.92■□□□□ 0.62
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CTDP1-208ENST00000613122 MBTPS1Q14703 1052 aa18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 VRK2Q86Y07 508 aa18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 OR5W2Q8NH69 310 aa18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 AMY2AP04746 511 aa18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRRQ15256 657 aa18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 ASB12Q8WXK4 309 aa18.91■□□□□ 0.62
CTDP1-208ENST00000613122 TXNDC15Q96J42 360 aa18.91■□□□□ 0.62
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