RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325942.10

FRAS1-201, Transcript of Fraser extracellular matrix complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRAS1, Length 7,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAS1-201ENST00000325942 SLC7A4O43246 635 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SLC43A1O75387 559 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 GYPBP06028 91 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 HOXA9P31269 272 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SHEQ5VZ18 495 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 CDS1Q92903 461 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 NMES1Q9C002 83 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SDCBP2Q9H190 292 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 DEPDC5O75140 1603 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 A0A1W2PPV4 95 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 DLL1O00548 723 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 IL2RAP01589 272 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 GPR19Q15760 415 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 CCNJQ5T5M9 372 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 FBXL14Q8N1E6 418 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 P4HTMQ9NXG6 502 aa9□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ICAM2P13598 275 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 HOXC5Q00444 222 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 GINS1Q14691 196 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SVOPLQ8N434 492 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 AUP1Q9Y679 476 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 C1orf226A1L170 272 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 M0QZ24 198 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 IFNA1P01562 189 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 RAP2AP10114 183 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 AGTR1P30556 359 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 KDELR2P33947 212 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 KCNJ11Q14654 390 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ST8SIA4Q92187 359 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF516Q92618 1163 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 AGPAT2O15120 278 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 CELP19835 753 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PTH2RP49190 550 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SYT4Q9H2B2 425 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF749O43361 778 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 IFNA10P01566 189 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TMEM65Q6PI78 240 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TMBIM1Q969X1 311 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 FAM210AQ96ND0 272 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 GFRA2O00451 464 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SSX4O60224 188 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TFPTP0C1Z6 253 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 GCGRP47871 477 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 CYB561P49447 251 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PTPRRQ15256 657 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 TGFBIQ15582 683 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 REEP3Q6NUK4 255 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 PARM1Q6UWI2 310 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 AAED1Q7RTV5 226 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 MRI1Q9BV20 369 aa8.99□□□□□ -0.97
FRAS1-201ENST00000325942 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms