RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9orf40Q8IXQ3 194 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAL3ST4Q96RP7 486 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTRCQ99895 268 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM2Q9C040 744 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBQLN4Q9NRR5 601 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF226Q9NYT6 803 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 AASSQ9UDR5 926 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNX5Q9Y5X3 404 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEN1O00255 615 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 XPNPEP2O43895 674 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM20BO75063 409 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TP53P04637 393 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 OMPP47874 163 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSPHP78330 225 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAAH2Q6GMR7 532 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 NLGN4XQ8N0W4 816 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 DUSP21Q9H596 190 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGES3LE9PB15 166 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TO15178 435 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOX14O95416 240 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRB1P18505 474 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCKBRP32239 447 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT20P35900 424 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 EMP2P54851 167 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM236Q5W0B7 351 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf47Q8NEP4 570 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4C3Q8NH37 302 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 NODALQ96S42 347 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS27Q9BQR3 290 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 WWTR1Q9GZV5 400 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6B1O95007 311 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTKP33981 857 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADH7P40394 386 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35A2P78381 396 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL26Q53HC5 615 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR141Q7Z602 305 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF440Q8IYI8 595 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPARTQ8N0X7 666 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM255BQ8WV15 326 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPBAP1Q96EW2 488 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRFN5Q96NI6 719 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPA33Q99795 319 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MUC3AQ02505 3323 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSTAP01040 98 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 FPR3P25089 353 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 STAT5AP42229 794 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR143P51810 404 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 C12orf73Q69YU5 71 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRMQ8IXM6 262 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 LSMEM1Q8N8F7 131 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF540Q8NDQ6 660 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMF1Q96S06 567 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBA1CQ9BQE3 449 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAGE2PA6NJ88 616 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 LYPD3O95274 346 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF806P0C7X5 589 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 HPGDP15428 266 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBED5Q49AG3 693 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 CASP12Q6UXS9 341 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 HS6ST2Q96MM7 605 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPSB2Q99619 263 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0B4J2E0 115 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1B0GX12 115 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTR1AP08908 422 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTCHD4Q6ZW05 846 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GNT7Q8NFL0 401 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMIGD2Q96BF3 282 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEMA4CQ9C0C4 833 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR54Q9H977 334 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf16Q9NQ32 467 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 B4E171 279 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCDO00767 359 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHP2O43745 196 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms