RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	NEURL2	Q9BR09	285 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HACD3	Q9P035	362 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NEDD4	P46934	1319 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MEI4	A8MW99	385 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM114	B3SHH9	223 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		H0YC42	278 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KMO	O15229	486 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GLRA3	O75311	464 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SCGB2A1	O75556	95 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TFAP2A	P05549	437 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OCM2	P0CE71	109 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BCKDHA	P12694	445 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CD1B	P29016	333 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ENTPD1	P49961	510 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CLDN17	P56750	224 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BNC1	Q01954	994 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXM1	Q08050	763 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLAMF1	Q13291	335 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIP10	Q15642	601 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DGUOK	Q16854	277 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	COPS6	Q7L5N1	327 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TEX26	Q8N6G2	289 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NUDT15	Q9NV35	164 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GIN1	Q9NXP7	522 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLX4	Q8IY92	1834 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PALLD	Q8WX93	1383 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HCRTR1	O43613	425 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CIDEA	O60543	219 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	STAMBP	O95630	424 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NDUFB7	P17568	137 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CMA1	P23946	247 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MMP11	P24347	488 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IFNA8	P32881	189 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NPY2R	P49146	381 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BLVRA	P53004	296 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CRMP1	Q14194	572 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	P2RY6	Q15077	328 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	EXT1	Q16394	746 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ALG10	Q5BKT4	473 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DCST2	Q5T1A1	773 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHC2	Q8IXK0	858 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GPC2	Q8N158	579 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RAB1C	Q92928	201 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SNF8	Q96H20	258 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MEIS3	Q99687	375 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SCML2	Q9UQR0	700 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IFT52	Q9Y366	437 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		2.57	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CKAP5	Q14008	2032 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A1W2PS18	150 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TXNDC9	O14530	226 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PFDN6	O15212	129 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXN1	O15353	648 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GMNN	O75496	209 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GPI	P06744	558 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CALCB	P10092	127 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ITGAM	P11215	1152 aa		2.56	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CDK4	P11802	303 aa		2.56	□□□□□ -2

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