RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 SERPINB4P48594 390 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CLDN20P56880 219 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CPTPQ5TA50 214 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 IL23RQ5VWK5 629 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 SMPDL3BQ92485 455 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 FIG4Q92562 907 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 STOML1Q9UBI4 398 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 MED13LQ71F56 2210 aa29.12■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 MSTNO14793 375 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 HPGDP15428 266 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM44Q2T9K0 475 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 KRT71Q3SY84 523 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 ZAR1Q86SH2 424 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 NUDCD3Q8IVD9 361 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 MREGQ8N565 214 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 OR5P2Q8WZ92 322 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 TUBGCP3Q96CW5 907 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CHMP6Q96FZ7 201 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 BTBD2Q9BX70 525 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 UBQLN4Q9NRR5 601 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 VDAC3Q9Y277 283 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF175Q9Y473 711 aa29.11■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 GOSR1O95249 250 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 HSPA4LO95757 839 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CPOXP36551 454 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 NATD1Q8N6N6 113 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 GATSQ8NAP1 163 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 STARD4Q96DR4 205 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 DACH2Q96NX9 599 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 FOXC2Q99958 501 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 DUSP22Q9NRW4 184 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 FBXO34Q9NWN3 711 aa29.1■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 A0A087WZY1 265 aa29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 SHISA8B8ZZ34 492 aa29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CTIFO43310 598 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF17P17021 662 aa29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CCNJQ5T5M9 372 aa29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 FNDC9Q8TBE3 224 aa29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 STACQ99469 402 aa29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 SH3D21A4FU49 640 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 SCDO00767 359 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PRPS1L1P21108 318 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 DNASE1P24855 282 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 CCT3P49368 545 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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TTC7B-202ENST00000553948 PON3Q15166 354 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 SPDYE7PQ495Y7 208 aa29.08■■■□□ 2.25
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TTC7B-202ENST00000553948 MISPQ8IVT2 679 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 METTL25Q8N6Q8 603 aa29.08■■■□□ 2.25
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TTC7B-202ENST00000553948 PSMA8Q8TAA3 256 aa29.08■■■□□ 2.25
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TTC7B-202ENST00000553948 COQ8BQ96D53 544 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PGM2Q96G03 612 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PKNOX2Q96KN3 472 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PIGUQ9H490 435 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 RNF122Q9H9V4 155 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 GIN1Q9NXP7 522 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 NDRG3Q9UGV2 375 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa29.08■■■□□ 2.25
TTC7B-202ENST00000553948 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF844Q08AG5 666 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 TP53BP2Q13625 1128 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 SGCBQ16585 318 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 BTLAQ7Z6A9 289 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 ACTRT2Q8TDY3 377 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 NUDT8Q8WV74 236 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 ACTRT3Q9BYD9 372 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 CXorf36Q9H7Y0 433 aa29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 C6orf47O95873 294 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 SIRPAP78324 504 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 CDC73Q6P1J9 531 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 GGNQ86UU5 652 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 RIMKLAQ8IXN7 391 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 ZBTB8AQ96BR9 441 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 PARD6BQ9BYG5 372 aa29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TTC7B-202ENST00000553948 CXXC4Q9H2H0 198 aa29.06■■■□□ 2.24
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