RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	AHRR	A9YTQ3	701 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	OIP5	O43482	229 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFB5	O43674	189 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC22A3	O75751	556 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TOX	O94900	526 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TGDS	O95455	350 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDN14	O95500	239 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ACTL6A	O96019	429 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GSN	P06396	782 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT16	P08779	473 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GABRA1	P14867	456 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	LCN1	P31025	176 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	LHX2	P50458	406 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	AQP5	P55064	265 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SRY	Q05066	204 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GSTA3	Q16772	222 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB8B	Q92930	207 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NEURL3	Q96EH8	262 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SFXN2	Q96NB2	322 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SDF2	Q99470	211 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NPAS1	Q99742	590 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985		Q9UFV3	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MAST4	O15021	2626 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC154	A6NI56	674 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SCD	O00767	359 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	FCMR	O60667	390 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	EPPIN	O95925	133 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CPN1	P15169	458 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CD1E	P15812	388 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	HK1	P19367	917 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP6V1C1	P21283	382 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CHRNB4	P30926	498 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDN18	P56856	261 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	FUT5	Q11128	374 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	MIER2	Q8N344	545 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	NAXE	Q8NCW5	288 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	VPS33A	Q96AX1	596 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	PANX1	Q96RD7	426 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PQD3	144 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985		H0YC42	278 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TPCN1-223	ENST00000552985	SOX30	O94993	753 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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