RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLDN11O75508 207 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 VAPBO95292 243 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CXCL14O95715 111 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TIMP1P01033 207 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV3-25P01717 112 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 RHOCP08134 193 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERPINF2P08697 491 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 MSH3P20585 1137 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC6A6P31641 620 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERPINB5P36952 375 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD86P42081 329 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD151P48509 253 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSRP3P50461 194 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUDT2P50583 147 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PDX1P52945 283 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDH4P55283 916 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKNOX1P55347 436 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 RELAQ04206 551 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 DMPKQ09013 629 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TWF1Q12792 350 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.816e-9■■■■■ 34
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMED1Q13445 227 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 FLOT2Q14254 428 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 POU6F1Q14863 301 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TGFBIQ15582 683 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PARP15Q460N3 678 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL23RQ5VWK5 629 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CORO6Q6QEF8 472 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINGO4Q6UY18 593 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADCK2Q7Z695 626 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 NFE4Q86UQ8 179 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNMB4Q86W47 210 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 LSMEM2Q8N112 164 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 NPWQ8N729 165 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKFN1Q8N957 763 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 GIPC3Q8TF64 312 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC107Q8WV48 283 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPSB1Q96BD6 273 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 RCN3Q96D15 328 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCRN2Q96FV2 425 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS39Q96JC1 886 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SGK494Q96LW2 274 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLHL5Q96PQ7 755 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL12RB2Q99665 862 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 DOK1Q99704 481 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC29A1Q99808 456 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 DRC3Q9H069 523 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 MMP28Q9H239 520 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYNNQ9NPC7 610 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL37Q9NZH6 218 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF150Q9ULK6 438 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 AP4S1Q9Y587 144 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A087WXM4 84 aa3.74□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.74□□□□□ -1.81
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms