RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 OR4F3Q6IEY1 312 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CDC73Q6P1J9 531 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SH3GL2Q99962 352 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OR2M5A3KFT3 312 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CFLARO15519 480 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CTSSP25774 331 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ASCL1P50553 236 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 LURAP1LQ8IV03 231 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OR5M1Q8NGP8 315 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OR5AK3PQ8NH89 298 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 WNT2BQ93097 391 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MOAP1Q96BY2 351 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MCCC2Q9HCC0 563 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 UBQLN4Q9NRR5 601 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 L3MBTL1Q9Y468 752 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SYT5O00445 386 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD28O15084 1053 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 NDUFB5O43674 189 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 GMFGO60234 142 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 LBPP18428 481 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 DGKQP52824 942 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ARSKQ6UWY0 536 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 GATSQ8NAP1 163 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OR8J2Q8NGG1 315 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TM9SF2Q99805 663 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 DPY30Q9C005 99 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 THAP1Q9NVV9 213 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 KCNN3Q9UGI6 736 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF337Q9Y3M9 751 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 KCNE3Q9Y6H6 103 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 HCRTR2O43614 444 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 KRT16P08779 473 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 PEPDP12955 493 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN15P56746 228 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 FOXF2Q12947 444 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 OGFOD2Q6N063 350 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTS15Q8TE58 950 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 LINC01387J3KSC0 135 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SDHDO14521 159 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SCN2BO60939 215 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 RCBTB2O95199 551 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 IL18BPO95998 194 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 OPRM1P35372 400 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SOAT1P35610 550 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 PHC1P78364 1004 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM44Q2T9K0 475 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 UBQLNLQ8IYU4 475 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 TESCQ96BS2 214 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 ZFP3Q96NJ6 502 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 PIGQQ9BRB3 760 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 HHATLQ9HCP6 504 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 HEATR5AQ86XA9 2040 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PQD3 144 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SHISA8B8ZZ34 492 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 H0YC42 278 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 HPGDP15428 266 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 UQCRC1P31930 480 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 CD226Q15762 336 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 DCST2Q5T1A1 773 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 OR7D2Q96RA2 312 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 JKAMPQ9P055 326 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 VDAC3Q9Y277 283 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 H3BML4 177 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SCDO00767 359 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 SOX30O94993 753 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 TGM6O95932 706 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 MYBPHQ13203 477 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 CASP8Q14790 479 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 BHLHB9Q6PI77 547 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD46Q86W74 232 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 MISPQ8IVT2 679 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 GCNT2Q8N0V5 402 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 MEIOBQ8N635 442 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 OR5D16Q8NGK9 328 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB3-202ENST00000460160 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms