RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 HAS2Q92819 552 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 HGDQ93099 445 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 POLE3Q9NRF9 147 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CALML5Q9NZT1 146 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 FLRT3Q9NZU0 649 aa27.15■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 CDK2AP1O14519 115 aa27.14■■□□□ 1.94
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ECHS1-201ENST00000368547 ICOSLGO75144 302 aa27.14■■□□□ 1.94
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ECHS1-201ENST00000368547 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF227Q86WZ6 799 aa27.14■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 NRG4Q8WWG1 115 aa27.14■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa27.14■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 PKP2Q99959 881 aa27.14■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 SAP130Q9H0E3 1048 aa27.14■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 PKD1L2Q7Z442 2459 aa27.14■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 NPIPA7E9PJI5 369 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TP53I11O14683 189 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PGM3O95394 542 aa27.13■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 PDGFAP04085 211 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 FAM87AP0C7U9 286 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPA8P0DM63 369 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 OR1C1Q15619 314 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 RTL4Q6ZR62 310 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 OR4C3Q8NH37 302 aa27.13■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 SGCZQ96LD1 299 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 NODALQ96S42 347 aa27.13■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 K7EM74 188 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0513O60268 411 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 NEURL1O76050 574 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PRKD3O94806 890 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 GUSBP08236 651 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 LCN1P31025 176 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 KCNAB2Q13303 367 aa27.12■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 TTC9Q92623 222 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TMCO6Q96DC7 493 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 VCX3BQ9H321 246 aa27.12■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 AQP1P29972 269 aa27.12■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 AP1ARQ63HQ0 302 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ENPP6Q6UWR7 440 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 BBS10Q8TAM1 723 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 LRTOMTQ8WZ04 291 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TM9SF4Q92544 642 aa27.12■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC47A1Q96FL8 570 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SEPHS2Q99611 448 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CHID1Q9BWS9 393 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa27.12■■□□□ 1.93
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ECHS1-201ENST00000368547 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CSAG2Q9Y5P2 127 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa27.12■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 DSPPQ9NZW4 1301 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 TIPRLO75663 272 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 DCTP40126 519 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 IGFL3Q6UXB1 125 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 HMGN2P46Q86SG4 172 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 FAM86B1Q8N7N1 296 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SPPL2AQ8TCT8 520 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 PAQR8Q8TEZ7 354 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D2AQ9NP31 389 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 UBQLN4Q9NRR5 601 aa27.11■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPB9F8W1W9 429 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CCL3P10147 92 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CD97P48960 835 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CRYBA2P53672 197 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 ATP12AP54707 1039 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 SLC22A10Q63ZE4 541 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 CATSPER1Q8NEC5 780 aa27.1■■□□□ 1.93
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD1Q9GZZ0 328 aa27.1■■□□□ 1.93
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