RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	PGC1	Q08959	321 aa		5	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	KSS1	P14681	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	IDI1	P15496	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	ATE1	P16639	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	NTG1	P31378	399 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YEL043W	P32618	956 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YKL050C	P35736	922 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	ECM4	P36156	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	TCD1	P38756	429 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	AIM46	P38885	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	IPL1	P38991	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YEN1	P40028	759 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	AGX1	P43567	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SNX4	P47057	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SPC19	Q03954	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	UBX2	Q04228	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SPO20	Q04359	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	GNT1	Q12096	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	AI1	P03875	834 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
MSE1	YOL033W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RAD4	P14736	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RSC6	P25632	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RAD27	P26793	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	CSE1	P33307	960 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	LHS1	P36016	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RSM22	P36056	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YSW1	P38280	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PSY2	P40164	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MNT3	P40549	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SAP185	P40856	1058 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PHB1	P40961	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	DIP5	P53388	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	ULP1	Q02724	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	ADE8	P04161	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MNN1	P39106	762 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MTW1	P39731	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	IES5	P40060	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	NDE1	P40215	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RSM25	P40496	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SAE2	P46946	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PEX8	P53248	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	FOL1	P53848	824 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	GIM3	P53900	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RSC4	Q02206	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	INP2	Q03824	705 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	NUT2	Q06213	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	ESC8	Q08119	714 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	XRS2	P33301	854 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PET112	P33893	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PTH2	P34222	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YRO2	P38079	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MIG2	P53035	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	SEC5	P89102	971 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	TAF11	Q04226	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	GAD1	Q04792	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	LOT6	Q07923	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	LAP2	Q10740	671 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MNL2	Q12205	849 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PHM7	Q12252	991 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MSE1	YOL033W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	MRC1	P25588	1096 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RIB7	P33312	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YKR018C	P36114	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YHL050C	P38721	697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YHR131C	P38835	850 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	YHR219W	P38900	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	SPT8	P38915	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	COG6	P53959	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	RRN5	Q02983	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSE1	YOL033W	LCD1	Q04377	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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