RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 STMN2Q93045 179 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 MX1P20591 662 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 SLFN5Q08AF3 891 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 OGFRQ9NZT2 677 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 CROCCP2Q86T23 111 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WZG4 1122 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 PTPRGP23470 1445 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 HAUS8Q9BT25 410 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 PRC1O43663 620 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SRGAP3O43295 1099 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 GBP1P32455 592 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF165P49910 485 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CNNM3Q8NE01 707 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 KIF14Q15058 1648 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 STX6O43752 255 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF76P36508 570 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 MXRA7P84157 204 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 JADE2Q9NQC1 790 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 PSMC4P43686 418 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 RASSF2P50749 326 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D5Q92609 795 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TRAF1Q13077 416 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF853P0CG23 659 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 FSIP1Q8NA03 581 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 MTMR7Q9Y216 660 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 GNG11P61952 73 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CFTRP13569 1480 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GUL7 405 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CABP2Q9NPB3 220 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 JPH4Q96JJ6 628 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM7Q9C029 511 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 RMND1Q9NWS8 449 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SSFA2P28290 1259 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1E1P36543 226 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 ARAP1Q96P48 1450 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 FCHSD2O94868 740 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CAPN2P17655 700 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 PPFIA1Q13136 1202 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SLF2Q8IX21 1173 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NBPF11Q86T75 865 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 HDXQ7Z353 690 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 THEGQ9P2T0 379 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SYNJ1O43426 1573 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CTAGE8P0CG41 777 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 SATB1Q01826 763 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 STRN4Q9NRL3 753 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 MCM6Q14566 821 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 CUL5Q93034 780 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NUF2Q9BZD4 464 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-209ENST00000612229 NCAPD3P42695 1498 aa7.94□□□□□ -1.14
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