RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 COL4A5P29400 1685 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC51AQ86UW1 340 aa33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF34Q8IZ26 560 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GPC2Q8N158 579 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC11AQ9Y240 323 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM88BA6NKF7 163 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NTSR2O95665 410 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ERBB4Q15303 1308 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf67Q6ZVT6 689 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 JDP2Q8WYK2 163 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP10Q7Z4F1 713 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPYL4Q9UJ04 414 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 VEGFBP49765 207 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTROBQ8N137 903 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 CRAMP1Q96RY5 1269 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 GJA3Q9Y6H8 435 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXN1O15353 648 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF6P56537 245 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 PDIA6Q15084 440 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 LTBP1Q14766 1721 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 PROSER3Q2NL68 480 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 LARGE2Q8N3Y3 721 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIPAP1Q4V328 841 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP10Q53GL7 1025 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA1P04083 346 aa33.75■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPK4P57078 832 aa33.75■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SCNN1DP51172 638 aa33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP3Q96P20 1036 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF10A6NK89 507 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 EPS15P42566 896 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC10A5Q5PT55 438 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NIM1KQ8IY84 436 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIP5K2O43314 1243 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPOP42166 694 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 BABAM1Q9NWV8 329 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC4O15439 1325 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 AOC3Q16853 763 aa33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB115Q30KQ5 88 aa33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 AIDAQ96BJ3 306 aa33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP33.67■■■□□ 2.985e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NECTIN2Q92692 538 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM10Q9NQV6 1147 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 WBP1LQ9NX94 342 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS6Q7L5N1 327 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 XAGE3Q8WTP9 111 aa33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 LMOD3Q0VAK6 560 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP10Q86W26 655 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-211ENST00000590874 RALBP1Q15311 655 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT24Q2M2I5 525 aa33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS33BQ9H267 617 aa33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC146Q8IYE0 955 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRC5DQ9NZD1 345 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF5O00463 557 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 LBX1P52954 281 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL9Q07325 125 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TCIRG1Q13488 830 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT20HQ8NEM7 779 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNRF3Q9ULT6 936 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMB2P55268 1798 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 BBOX1O75936 387 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROD2Q15784 382 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SP8Q8IXZ3 490 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3TC1Q8TE82 1336 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CHL1O00533 1208 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CST9Q5W186 159 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MPNDQ8N594 471 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF428Q96B54 188 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAPQ13588 217 aa33.55■■■□□ 2.96
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