RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 ALDH1B1P30837 517 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 FZD9O00144 591 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 RALBP1Q15311 655 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 LDHDQ86WU2 507 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 PSMD1Q99460 953 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 PASKQ96RG2 1323 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 KRT24Q2M2I5 525 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 CREBZFQ9NS37 354 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 NECTIN2Q92692 538 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 EPHX2P34913 555 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 HACL1Q9UJ83 578 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 TAF1P21675 1872 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 NEUROD2Q15784 382 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 PARP10Q53GL7 1025 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 GPC2Q8N158 579 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.89■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 CNTNAP1P78357 1384 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 ABCC4O15439 1325 aa15.88■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 COPS6Q7L5N1 327 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 JDP2Q8WYK2 163 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 ZNF428Q96B54 188 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 CHL1O00533 1208 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 SCNN1DP51172 638 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 NLRP10Q86W26 655 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 COL4A1P02462 1669 aa15.86■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 TNS4Q8IZW8 715 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 NLRP3Q96P20 1036 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.85■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.84■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 AOC3Q16853 763 aa15.84■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 RUNDC1Q96C34 613 aa15.84■□□□□ 0.13
CTIF-208ENST00000590422 PPIP5K2O43314 1243 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 EPS15P42566 896 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 TCIRG1Q13488 830 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 NIM1KQ8IY84 436 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 CNTROBQ8N137 903 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 CAPN15O75808 1086 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 VEGFBP49765 207 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 FOXN1O15353 648 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 GRAPQ13588 217 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 MBIPQ9NS73 344 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 RASSF10A6NK89 507 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-208ENST00000590422 TRAF5O00463 557 aa15.78■□□□□ 0.12
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