RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IFT140Q96RY7 1462 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCC8Q09428 1581 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ERBB4Q15303 1308 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZBTB39O15060 712 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MICAL2O94851 1124 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TREML1Q86YW5 311 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WDR97A6NE52 1622 aa9.38□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BRB1 525 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ICMTO60725 284 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MPSTP25325 297 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SYNJ1O43426 1573 aa9.37□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IDH3AP50213 366 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TYRO3Q06418 890 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IER5Q5VY09 327 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.36□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNP2Q05952 138 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATCAYQ86WG3 371 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BRD7Q9NPI1 651 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HCN2Q9UL51 889 aa9.35□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OPLAHO14841 1288 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM157BP0CG42 384 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VSIG8P0DPA2 414 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 INPP5BP32019 993 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABTB2Q8N961 1025 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IRF7Q92985 503 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STRN4Q9NRL3 753 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP20Q9Y2K6 914 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EFSO43281 561 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM13AO94988 1023 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NPR3P17342 541 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZAP70P43403 619 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PHF24Q9UPV7 400 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOGA1O94964 1423 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WFS1O76024 890 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CD33P20138 364 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AAMPQ13685 434 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GAS6Q14393 721 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ECM1Q16610 540 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCE2CQ5TA81 110 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHD1O14646 1710 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FGFR3P22607 806 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARSDP51689 593 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CTBSQ01459 385 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRIN2CQ14957 1233 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPR152Q8TDT2 470 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MARK1Q9P0L2 795 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TOP2BQ02880 1626 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARHGAP4P98171 946 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TREML4Q6UXN2 200 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EPB42P16452 691 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MX2P20592 715 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GMPRP36959 345 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNQ4P56696 695 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRT76Q01546 638 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LAMC2Q13753 1193 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EDEM1Q92611 657 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C2CD2LO14523 706 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms