RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, human

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A4-208	ENST00000572010	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	RIPK4	P57078	832 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	SCN4A	P35499	1836 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	CAPN15	O75808	1086 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	NLRP3	Q96P20	1036 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	PCNT	O95613	3336 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	NUP98	P52948	1817 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC12A4-208	ENST00000572010	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	NTSR2	O95665	410 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	RALBP1	Q15311	655 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	PDIA6	Q15084	440 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC12A4-208	ENST00000572010	VEGFB	P49765	207 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	ANXA1	P04083	346 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	VPS33B	Q9H267	617 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	BBOX1	O75936	387 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	FOXN1	O15353	648 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	EPS15	P42566	896 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SLC12A4-208	ENST00000572010	SCNN1D	P51172	638 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	AOC3	Q16853	763 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	ABCC4	O15439	1325 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	SP8	Q8IXZ3	490 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	27.75	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLC51A	Q86UW1	340 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	COL4A5	P29400	1685 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	CHL1	O00533	1208 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	MPND	Q8N594	471 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.72	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
SLC12A4-208	ENST00000572010	CXCL9	Q07325	125 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	GRAP	Q13588	217 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SLC12A4-208	ENST00000572010	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02

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