RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNED1Q8TER0 1413 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUP98P52948 1817 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPTP24298 496 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYL6BP14649 208 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.87■■□□□ 1.25
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USP3-AS1-210ENST00000561256 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RASSF10A6NK89 507 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 WBP1LQ9NX94 342 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL4A5P29400 1685 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUSD4Q5VX71 490 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 LBX1P52954 281 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 NFE2L2Q16236 605 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCNN1DP51172 638 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 LTBP1Q14766 1721 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 NTSR2O95665 410 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPS15P42566 896 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 NIM1KQ8IY84 436 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERBB4Q15303 1308 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC51AQ86UW1 340 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPIP5K2O43314 1243 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARP10Q53GL7 1025 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 NLRP3Q96P20 1036 aa22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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USP3-AS1-210ENST00000561256 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.75■■□□□ 1.23
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USP3-AS1-210ENST00000561256 ECE1P42892 770 aa22.74■■□□□ 1.23
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USP3-AS1-210ENST00000561256 CAPNS2Q96L46 248 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 VPS33BQ9H267 617 aa22.74■■□□□ 1.23
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USP3-AS1-210ENST00000561256 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCC4O15439 1325 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDIA6Q15084 440 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 CST9Q5W186 159 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.71■■□□□ 1.23
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USP3-AS1-210ENST00000561256 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.71■■□□□ 1.23
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USP3-AS1-210ENST00000561256 PROSER3Q2NL68 480 aa22.7■■□□□ 1.22
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USP3-AS1-210ENST00000561256 ABHD8Q96I13 439 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 BBOX1O75936 387 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIPK4P57078 832 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 SP8Q8IXZ3 490 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 MPNDQ8N594 471 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 COPS6Q7L5N1 327 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-210ENST00000561256 NLRP10Q86W26 655 aa22.66■■□□□ 1.22
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