RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 KIF4AO95239 1232 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CERS3Q8IU89 383 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TSPY2A6NKD2 308 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ERMNQ8TAM6 284 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NLRP3Q96P20 1036 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO3Q9UK99 471 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ATP10AO60312 1499 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 MCM5P33992 734 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP100Q494V2 611 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 RMND1Q9NWS8 449 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NF2P35240 595 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD62A6NC57 917 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 KIF5CO60282 957 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NEMFO60524 1076 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V1AP38606 617 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CNNM3Q8NE01 707 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD9Q5K651 1589 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 POLD1P28340 1107 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF14Q5TI25 921 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CASQ1P31415 396 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GSDMDP57764 484 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 FLT4P35916 1363 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NPATQ14207 1427 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 MYZAPP0CAP1 466 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TSPY3P0CV98 308 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TSPY8P0CW00 308 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 DDB1Q16531 1140 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PLVAPQ9BX97 442 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GRM8O00222 908 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 IL2RBP14784 551 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 WDR78Q5VTH9 848 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ALDH1L1O75891 902 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CALM1P0DP23 149 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CALM2P0DP24 149 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 CALM3P0DP25 149 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ESR2Q92731 530 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 DDX11Q96FC9 970 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 GPTP24298 496 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D5Q92609 795 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 STAMBPO95630 424 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TNNI2P48788 182 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 HOOK3Q86VS8 718 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 NEK1Q96PY6 1258 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 EYA3Q99504 573 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 RTL9Q8NET4 1388 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 WTAPQ15007 396 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 STX1AQ16623 288 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-226ENST00000546160 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.36□□□□□ -1.23
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