RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 KRT24Q2M2I5 525 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC51AQ86UW1 340 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 JMYQ8N9B5 988 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 NECTIN2Q92692 538 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 RUNDC1Q96C34 613 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 SYNE4Q8N205 404 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KCNQ1-206ENST00000526095 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 CHL1O00533 1208 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PARP10Q53GL7 1025 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 TAF1P21675 1872 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 CHADLQ6NUI6 762 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PSMD1Q99460 953 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PCNTO95613 3336 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 COPS6Q7L5N1 327 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 FZD9O00144 591 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 LTBP1Q14766 1721 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNQ1-206ENST00000526095 NLRP10Q86W26 655 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 NLRP3Q96P20 1036 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 LDHDQ86WU2 507 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HACL1Q9UJ83 578 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 TCIRG1Q13488 830 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 JDP2Q8WYK2 163 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCC4O15439 1325 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 GPC2Q8N158 579 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 PASKQ96RG2 1323 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 HOXB7P09629 217 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 EPHX2P34913 555 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF428Q96B54 188 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 CFAP44Q96MT7 982 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 CREBZFQ9NS37 354 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 MBIPQ9NS73 344 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-206ENST00000526095 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 COL4A1P02462 1669 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 APAF1O14727 1248 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF853P0CG23 659 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 PPIP5K2O43314 1243 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 AOC3Q16853 763 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 NIM1KQ8IY84 436 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 BBOX1O75936 387 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 SCNN1DP51172 638 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 SP8Q8IXZ3 490 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 HYPKQ9NX55 129 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 CNTNAP1P78357 1384 aa20.34■□□□□ 0.85
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms