RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 NECTIN2Q92692 538 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 PARP10Q53GL7 1025 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 SNED1Q8TER0 1413 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 PSMD1Q99460 953 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 FZD9O00144 591 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 COPS6Q7L5N1 327 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 RUNDC1Q96C34 613 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 CHL1O00533 1208 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 KRT24Q2M2I5 525 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC51AQ86UW1 340 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 LDHDQ86WU2 507 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 JDP2Q8WYK2 163 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 NLRP3Q96P20 1036 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 SCN4AP35499 1836 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 HACL1Q9UJ83 578 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.133e-6■■■□□ 18.6
HERC3-211ENST00000513325 CREBZFQ9NS37 354 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 EPHX2P34913 555 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 NLRP10Q86W26 655 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 GPC2Q8N158 579 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 TCIRG1Q13488 830 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 COL4A5P29400 1685 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 PASKQ96RG2 1323 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-211ENST00000513325 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 ABCC4O15439 1325 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 ZNF428Q96B54 188 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 CFAP44Q96MT7 982 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 PPIP5K2O43314 1243 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 HOXB7P09629 217 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 NIM1KQ8IY84 436 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 BBOX1O75936 387 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 AOC3Q16853 763 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 SP8Q8IXZ3 490 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 CNTROBQ8N137 903 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 MBIPQ9NS73 344 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-211ENST00000513325 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 SCNN1DP51172 638 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 LAMB2P55268 1798 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 CNTNAP1P78357 1384 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 PCNTO95613 3336 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 APAF1O14727 1248 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 EPS15P42566 896 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 VPS33BQ9H267 617 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 LTBP1Q14766 1721 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 GRAPQ13588 217 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 MPNDQ8N594 471 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-211ENST00000513325 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.99■■□□□ 1.11
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