RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512780.2

STX18-209, Transcript of syntaxin 18, humanhuman

TSL 3

Gene STX18, Length 800 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX18-209ENST00000512780 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.74■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 JMYQ8N9B5 988 aa26.74■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 PROSER3Q2NL68 480 aa26.73■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.73■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 NTSR2O95665 410 aa26.72■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 PDIA6Q15084 440 aa26.71■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 PARP10Q53GL7 1025 aa26.71■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.71■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.71■■□□□ 1.87
STX18-209ENST00000512780 JDP2Q8WYK2 163 aa26.7■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 RUNDC1Q96C34 613 aa26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 PSMD1Q99460 953 aa26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.69■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 COPS6Q7L5N1 327 aa26.68■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.68■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 LDHDQ86WU2 507 aa26.68■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 NLRP3Q96P20 1036 aa26.68■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 HACL1Q9UJ83 578 aa26.68■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.67■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.67■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.66■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 FZD9O00144 591 aa26.66■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 KRT24Q2M2I5 525 aa26.66■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.66■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.66■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.65■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 EPHX2P34913 555 aa26.64■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 SLC51AQ86UW1 340 aa26.64■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.64■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 CREBZFQ9NS37 354 aa26.64■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.64■■□□□ 1.86
STX18-209ENST00000512780 PCNTO95613 3336 aa26.64■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 SNED1Q8TER0 1413 aa26.64■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.63■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 GPC2Q8N158 579 aa26.63■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 LAMB2P55268 1798 aa26.63■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 CHL1O00533 1208 aa26.62■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 ZNF428Q96B54 188 aa26.62■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.61■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.61■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 ABCC4O15439 1325 aa26.61■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 COL4A5P29400 1685 aa26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 NLRP10Q86W26 655 aa26.6■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 TCIRG1Q13488 830 aa26.59■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.59■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 NIM1KQ8IY84 436 aa26.59■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 PPIP5K2O43314 1243 aa26.58■■□□□ 1.85
STX18-209ENST00000512780 ANP32CO43423 234 aa26.57■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 CCDC184Q52MB2 194 aa26.57■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.57■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.57■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 PASKQ96RG2 1323 aa26.57■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.56■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 AOC3Q16853 763 aa26.56■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 TAF1P21675 1872 aa26.55■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.54■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 HOXB7P09629 217 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 CNTROBQ8N137 903 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 CFAP44Q96MT7 982 aa26.53■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 BBOX1O75936 387 aa26.52■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 LTBP1Q14766 1721 aa26.52■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 MBIPQ9NS73 344 aa26.52■■□□□ 1.84
STX18-209ENST00000512780 CNTNAP1P78357 1384 aa26.51■■□□□ 1.83
STX18-209ENST00000512780 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.51■■□□□ 1.83
STX18-209ENST00000512780 APAF1O14727 1248 aa26.51■■□□□ 1.83
STX18-209ENST00000512780 TNS4Q8IZW8 715 aa26.51■■□□□ 1.83
STX18-209ENST00000512780 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
STX18-209ENST00000512780 EPS15P42566 896 aa26.5■■□□□ 1.83
STX18-209ENST00000512780 SCNN1DP51172 638 aa26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms