RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ABTB2Q8N961 1025 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 RNF34Q969K3 372 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 FAM129BQ96TA1 746 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 MRS2Q9HD23 443 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 ANO2Q9NQ90 1003 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 GIPC1O14908 333 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PTGIRP43119 386 aa3.3□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 SCARF1Q14162 830 aa3.3□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa3.3□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 MYO19Q96H55 970 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 TINF2Q9BSI4 451 aa3.3□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 TXLNAP40222 546 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 PODNQ7Z5L7 613 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A9Q96Q91 983 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 LRFN2Q9ULH4 789 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 SMTNP53814 917 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 C16orf46Q6P387 395 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 CYP2U1Q7Z449 544 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 SVOPQ8N4V2 548 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-218ENST00000509368 PAX4O43316 350 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-218ENST00000509368 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 GPAMQ9HCL2 828 aa3.27□□□□□ -1.89
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