RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYL6BP14649 208 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NUP98P52948 1817 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 EPHX2P34913 555 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NLRP3Q96P20 1036 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 POTEIP0CG38 1075 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 POTEJP0CG39 1038 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIPK4P57078 832 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SUSD4Q5VX71 490 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TNS4Q8IZW8 715 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 SNED1Q8TER0 1413 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC12Q96J65 1359 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 NTSR2O95665 410 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPTP24298 496 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 OLFM4Q6UX06 510 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CNTNAP1P78357 1384 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 PDIA6Q15084 440 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 BBOX1O75936 387 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 CNTROBQ8N137 903 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 NIM1KQ8IY84 436 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHL1O00533 1208 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 HOXB7P09629 217 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMC4Q7Z404 712 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 RASSF10A6NK89 507 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 TCIRG1Q13488 830 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 SP8Q8IXZ3 490 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 AIDAQ96BJ3 306 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 COPS6Q7L5N1 327 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 NLRP10Q86W26 655 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPIP5K2O43314 1243 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 VEGFBP49765 207 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 RUNDC1Q96C34 613 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCNN1DP51172 638 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 PROSER3Q2NL68 480 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 MPNDQ8N594 471 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 WBP1LQ9NX94 342 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC4O15439 1325 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 EPS15P42566 896 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRAPQ13588 217 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 TNIP1Q15025 636 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 FOXN1O15353 648 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 ECE1P42892 770 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 AOC3Q16853 763 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANXA1P04083 346 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 COL4A5P29400 1685 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFAP44Q96MT7 982 aa21.93■■□□□ 1.1
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