RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-215ENST00000493976 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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AKAP9-215ENST00000493976 KRT24Q2M2I5 525 aa20.88■□□□□ 0.93
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AKAP9-215ENST00000493976 NEUROD2Q15784 382 aa20.86■□□□□ 0.93
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AKAP9-215ENST00000493976 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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AKAP9-215ENST00000493976 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
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AKAP9-215ENST00000493976 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
AKAP9-215ENST00000493976 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.67■□□□□ 0.9
AKAP9-215ENST00000493976 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.67■□□□□ 0.9
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AKAP9-215ENST00000493976 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
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AKAP9-215ENST00000493976 CNTROBQ8N137 903 aa20.66■□□□□ 0.9
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