RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 NEUROD2Q15784 382 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 PSMD1Q99460 953 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 PROSER3Q2NL68 480 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 CHADLQ6NUI6 762 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 SYNE4Q8N205 404 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 CHL1O00533 1208 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 ANXA1P04083 346 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 LAMB2P55268 1798 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 NECTIN2Q92692 538 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-208ENST00000493601 FZD9O00144 591 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 LDHDQ86WU2 507 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 JDP2Q8WYK2 163 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 NLRP3Q96P20 1036 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 POTEIP0CG38 1075 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 POTEJP0CG39 1038 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 COPS6Q7L5N1 327 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 HOXB7P09629 217 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 GPC2Q8N158 579 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 HACL1Q9UJ83 578 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 COL4A5P29400 1685 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 KRT24Q2M2I5 525 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 NLRP10Q86W26 655 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 CREBZFQ9NS37 354 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 TCIRG1Q13488 830 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-208ENST00000493601 ABCC4O15439 1325 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 EPHX2P34913 555 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 CFAP44Q96MT7 982 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 PASKQ96RG2 1323 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 SLC51AQ86UW1 340 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 NIM1KQ8IY84 436 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 PPIP5K2O43314 1243 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 BBOX1O75936 387 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 VPS33BQ9H267 617 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 MBIPQ9NS73 344 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 HYPKQ9NX55 129 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 LTBP1Q14766 1721 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 AOC3Q16853 763 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 IFT57Q9NWB7 429 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-208ENST00000493601 APAF1O14727 1248 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 GRAPQ13588 217 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 SP8Q8IXZ3 490 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 TAF1P21675 1872 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 CNTNAP1P78357 1384 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF853P0CG23 659 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 SCNN1DP51172 638 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 GNAI1P63096 354 aa21.56■■□□□ 1.04
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