RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 DYRK1BQ9Y463 629 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PNR3 127 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP42Q96MM3 310 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 F11P03951 625 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 TCF3P15923 654 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 XKR5Q6UX68 686 aa12.48□□□□□ -0.41
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PTPRC-212ENST00000491302 FBF1Q8TES7 1133 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 CSRNP1Q96S65 589 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 MRS2Q9HD23 443 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP8Q86W28 1048 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 PARP2Q9UGN5 583 aa12.47□□□□□ -0.41
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PTPRC-212ENST00000491302 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRC-212ENST00000491302 KLRG1Q96E93 195 aa12.46□□□□□ -0.41
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PTPRC-212ENST00000491302 FRMD6Q96NE9 622 aa12.46□□□□□ -0.41
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PTPRC-212ENST00000491302 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 EFHC2Q5JST6 749 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 SORBS3O60504 671 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 DAB2P98082 770 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD2Q13200 908 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 LBRQ14739 615 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD5Q5TGI4 173 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF438Q7Z4V0 828 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 GPAMQ9HCL2 828 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 MAN1A2O60476 641 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 RECKO95980 971 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 TYRO3Q06418 890 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 LAPTM4AQ15012 233 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 RUBCNLQ9H714 662 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 A6NHS1 94 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 ORC1Q13415 861 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 KCNMB2Q9Y691 235 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF21O75509 655 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 GNA15P30679 374 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 FIGNL1Q6PIW4 674 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 BACH2Q9BYV9 841 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 BRD7Q9NPI1 651 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 USP20Q9Y2K6 914 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRC-212ENST00000491302 EGFRP00533 1210 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 ELP3Q9H9T3 547 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 SPG7Q9UQ90 795 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 XYLBO75191 536 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 VTI1BQ9UEU0 232 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 PHACTR2O75167 634 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 FAM161BQ96MY7 647 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 SETDB2Q96T68 719 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 H7C1W4 665 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 GIPC1O14908 333 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 KCNQ4P56696 695 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 PMEPA1Q969W9 287 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 KCNH4Q9UQ05 1017 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 FAM157BP0CG42 384 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP13Q86W25 1043 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 AAASQ9NRG9 546 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 AK5Q9Y6K8 562 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa12.34□□□□□ -0.43
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PTPRC-212ENST00000491302 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 KIFC2Q96AC6 838 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 SENP2Q9HC62 589 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 RNF19AQ9NV58 838 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 PTSQ03393 145 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 LAMC2Q13753 1193 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-212ENST00000491302 GMCL1Q96IK5 515 aa12.32□□□□□ -0.44
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