RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.03■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 MYL6BP14649 208 aa23.02■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 GPTP24298 496 aa23.02■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.02■■□□□ 1.28
PKDCC-208ENST00000490302 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.01■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.01■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.01■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.01■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.01■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 RASSF10A6NK89 507 aa23■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 SUSD4Q5VX71 490 aa23■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 WBP1LQ9NX94 342 aa23■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.99■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.99■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 NFE2L2Q16236 605 aa22.99■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.99■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.98■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 COL4A5P29400 1685 aa22.97■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 NUP98P52948 1817 aa22.97■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 NTSR2O95665 410 aa22.97■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 ERBB4Q15303 1308 aa22.96■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 LBX1P52954 281 aa22.96■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.96■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
PKDCC-208ENST00000490302 EPS15P42566 896 aa22.95■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 SCNN1DP51172 638 aa22.95■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 NIM1KQ8IY84 436 aa22.95■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.94■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 PARP10Q53GL7 1025 aa22.94■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 NLRP3Q96P20 1036 aa22.94■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.94■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.93■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 SLC51AQ86UW1 340 aa22.93■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 LTBP1Q14766 1721 aa22.93■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 PPIP5K2O43314 1243 aa22.92■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.91■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 VPS33BQ9H267 617 aa22.91■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.91■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 AOC3Q16853 763 aa22.9■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.9■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PKDCC-208ENST00000490302 ECE1P42892 770 aa22.89■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.89■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.89■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 PDIA6Q15084 440 aa22.88■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 CAPNS2Q96L46 248 aa22.88■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 ABCC4O15439 1325 aa22.87■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 TRAF5O00463 557 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 CST9Q5W186 159 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.86■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 ANXA1P04083 346 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 CXCL9Q07325 125 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 GRM1Q13255 1194 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 PROSER3Q2NL68 480 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 BBOX1O75936 387 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 RIPK4P57078 832 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 SP8Q8IXZ3 490 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.84■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 MPNDQ8N594 471 aa22.83■■□□□ 1.25
PKDCC-208ENST00000490302 COPS6Q7L5N1 327 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 ABHD8Q96I13 439 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 NLRP10Q86W26 655 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.82■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.81■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PKDCC-208ENST00000490302 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.81■■□□□ 1.24
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