RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PDIA6Q15084 440 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 OLFM4Q6UX06 510 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 SYNE4Q8N205 404 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 KLRG1Q96E93 195 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 CHL1O00533 1208 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 NTSR2O95665 410 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 COPS6Q7L5N1 327 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
ACTB-212ENST00000484841 SCN4AP35499 1836 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 PROSER3Q2NL68 480 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 JDP2Q8WYK2 163 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 CHADLQ6NUI6 762 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 PSMD1Q99460 953 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 HOXB7P09629 217 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 TCIRG1Q13488 830 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 KRT24Q2M2I5 525 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 CFAP44Q96MT7 982 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.2■■□□□ 1.79
ACTB-212ENST00000484841 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 IFFO2Q5TF58 517 aa26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 HACL1Q9UJ83 578 aa26.2■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 LDHDQ86WU2 507 aa26.19■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 FZD9O00144 591 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 NLRP10Q86W26 655 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 GPC2Q8N158 579 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 JMYQ8N9B5 988 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 APAF1O14727 1248 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 HYPKQ9NX55 129 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 LAMB2P55268 1798 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 POTEIP0CG38 1075 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 POTEJP0CG39 1038 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 EPHX2P34913 555 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 GNAI1P63096 354 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 NIM1KQ8IY84 436 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 MBIPQ9NS73 344 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-212ENST00000484841 ABCC4O15439 1325 aa26.14■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 BBOX1O75936 387 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 SNED1Q8TER0 1413 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 PPIP5K2O43314 1243 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 CREBZFQ9NS37 354 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 IFT57Q9NWB7 429 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 VPS33BQ9H267 617 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 SP8Q8IXZ3 490 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA2Q08379 1002 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 MPNDQ8N594 471 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 ZNF428Q96B54 188 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-212ENST00000484841 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 GRAPQ13588 217 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 AOC3Q16853 763 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 TMC4Q7Z404 712 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 ZNF853P0CG23 659 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 COL4A5P29400 1685 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 FAM89AQ96GI7 184 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 PASKQ96RG2 1323 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 TAF1P21675 1872 aa26.03■■□□□ 1.76
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