RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 FZD9O00144 591 aa19.87■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.87■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 DUOX1Q9NRD9 1551 aa19.87■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 NEFMP07197 916 aa19.86■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 IARSP41252 1262 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 CHADLQ6NUI6 762 aa19.86■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 SYNE4Q8N205 404 aa19.86■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 CHL1O00533 1208 aa19.85■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 PSMD1Q99460 953 aa19.85■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 NYXQ9GZU5 481 aa19.85■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19.85■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 ALDH1B1P30837 517 aa19.84■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 RTKN2Q8IZC4 609 aa19.84■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.84■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.83■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 NECTIN2Q92692 538 aa19.83■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 SLC10A5Q5PT55 438 aa19.82■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.82■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 CRAMP1Q96RY5 1269 aa19.82■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 COPS6Q7L5N1 327 aa19.81■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 NLRP10Q86W26 655 aa19.81■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.81■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 ABCC4O15439 1325 aa19.8■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 PARP10Q53GL7 1025 aa19.8■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 LDHDQ86WU2 507 aa19.8■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 CREBZFQ9NS37 354 aa19.8■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 NEUROD2Q15784 382 aa19.79■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 ZNF428Q96B54 188 aa19.79■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 IQCA1LA6NCM1 817 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 EPHX2P34913 555 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 SCNN1DP51172 638 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 RUNDC1Q96C34 613 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 HACL1Q9UJ83 578 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 CNTNAP1P78357 1384 aa19.78■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 GPC2Q8N158 579 aa19.77■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
TNS1-216ENST00000480665 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 THSD7BQ9C0I4 1608 aa19.76■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 ZNF853P0CG23 659 aa19.75■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 TCIRG1Q13488 830 aa19.75■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 AOC3Q16853 763 aa19.74■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 EPS15P42566 896 aa19.73■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 NLRP3Q96P20 1036 aa19.73■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.73■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 MBIPQ9NS73 344 aa19.73■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 LARGE2Q8N3Y3 721 aa19.72■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 HOXB7P09629 217 aa19.71■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.71■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 CFAP44Q96MT7 982 aa19.71■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
TNS1-216ENST00000480665 CCDC184Q52MB2 194 aa19.7■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 CNTROBQ8N137 903 aa19.7■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 JDP2Q8WYK2 163 aa19.7■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 GJA3Q9Y6H8 435 aa19.7■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 PPIP5K2O43314 1243 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 VEGFBP49765 207 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.69■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 TMEM88BA6NKF7 163 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 YDJCA8MPS7 323 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 EIF6P56537 245 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 CXCL9Q07325 125 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 GRAPQ13588 217 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 GRIPAP1Q4V328 841 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 SP8Q8IXZ3 490 aa19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms