RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 PARP10Q53GL7 1025 aa25.24■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.23■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 PSMD1Q99460 953 aa25.23■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.22■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 LDHDQ86WU2 507 aa25.22■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 JDP2Q8WYK2 163 aa25.22■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 HACL1Q9UJ83 578 aa25.22■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 FZD9O00144 591 aa25.21■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 COPS6Q7L5N1 327 aa25.21■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 NLRP3Q96P20 1036 aa25.21■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.21■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SHQ1-206ENST00000471526 RUNDC1Q96C34 613 aa25.2■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.2■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 NUP98P52948 1817 aa25.2■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 EPHX2P34913 555 aa25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 KRT24Q2M2I5 525 aa25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 SLC51AQ86UW1 340 aa25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 CREBZFQ9NS37 354 aa25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.19■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.18■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 CHL1O00533 1208 aa25.18■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 SNED1Q8TER0 1413 aa25.17■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 GPC2Q8N158 579 aa25.16■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.16■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.15■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 NLRP10Q86W26 655 aa25.14■■□□□ 1.62
SHQ1-206ENST00000471526 PASKQ96RG2 1323 aa25.13■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 TCIRG1Q13488 830 aa25.13■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF428Q96B54 188 aa25.12■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.12■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.12■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.11■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 NIM1KQ8IY84 436 aa25.11■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 ABCC4O15439 1325 aa25.11■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 SCN4AP35499 1836 aa25.1■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 PPIP5K2O43314 1243 aa25.1■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 AOC3Q16853 763 aa25.1■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 CNTROBQ8N137 903 aa25.1■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 COL4A5P29400 1685 aa25.1■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.09■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 BBOX1O75936 387 aa25.08■■□□□ 1.61
SHQ1-206ENST00000471526 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.08■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 EPS15P42566 896 aa25.07■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 TNS4Q8IZW8 715 aa25.07■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 CFAP44Q96MT7 982 aa25.07■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 CNTNAP1P78357 1384 aa25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 SP8Q8IXZ3 490 aa25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 HOXB7P09629 217 aa25.05■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 SCNN1DP51172 638 aa25.05■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.05■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 MPNDQ8N594 471 aa25.05■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 VPS33BQ9H267 617 aa25.05■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 GRAPQ13588 217 aa25.04■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 MBIPQ9NS73 344 aa25.04■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.03■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.03■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 VEGFBP49765 207 aa25.02■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 FAM89AQ96GI7 184 aa25.02■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 HYPKQ9NX55 129 aa25.02■■□□□ 1.6
SHQ1-206ENST00000471526 APAF1O14727 1248 aa25.01■■□□□ 1.59
SHQ1-206ENST00000471526 CAPN15O75808 1086 aa25.01■■□□□ 1.59
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