RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NTSR2O95665 410 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PARP10Q53GL7 1025 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUSD4Q5VX71 490 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NGEFQ8N5V2 710 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL4A5P29400 1685 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LAMB2P55268 1798 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LTBP1Q14766 1721 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYL6BP14649 208 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRP10Q7Z4F1 713 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VPS33BQ9H267 617 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPTP24298 496 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EIF6P56537 245 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNTROBQ8N137 903 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RASSF10A6NK89 507 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PDIA6Q15084 440 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRDM10Q9NQV6 1147 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.52□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VEGFBP49765 207 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NLRP3Q96P20 1036 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCNN1DP51172 638 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RIPK4P57078 832 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RALBP1Q15311 655 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WBP1LQ9NX94 342 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 THSD7BQ9C0I4 1608 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FOXN1O15353 648 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TAF1P21675 1872 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAPN15O75808 1086 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BBOX1O75936 387 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AIDAQ96BJ3 306 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABCC4O15439 1325 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PROSER3Q2NL68 480 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SP8Q8IXZ3 490 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NIM1KQ8IY84 436 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPIP5K2O43314 1243 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EPS15P42566 896 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCIRG1Q13488 830 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COPS6Q7L5N1 327 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NLRP10Q86W26 655 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNRF3Q9ULT6 936 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHL1O00533 1208 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AOC3Q16853 763 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMC4Q7Z404 712 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPRC5DQ9NZD1 345 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SH3TC1Q8TE82 1336 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANXA1P04083 346 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOXB7P09629 217 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXCL9Q07325 125 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC51AQ86UW1 340 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ECE1P42892 770 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRAPQ13588 217 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MPNDQ8N594 471 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms