RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446182.5

PTPRN-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, human

TSL 5

Gene PTPRN, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRN-208	ENST00000446182	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	GPC2	Q8N158	579 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	COL4A5	P29400	1685 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	FOXN1	O15353	648 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	VEGFB	P49765	207 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	NTSR2	O95665	410 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	NUP98	P52948	1817 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRN-208	ENST00000446182	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PDIA6	Q15084	440 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	SCNN1D	P51172	638 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	EPS15	P42566	896 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	ANXA1	P04083	346 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	RIPK4	P57078	832 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	AOC3	Q16853	763 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	ABCC4	O15439	1325 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRN-208	ENST00000446182	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	LBX1	P52954	281 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	TRAF5	O00463	557 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CXCL9	Q07325	125 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	BBOX1	O75936	387 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CST9	Q5W186	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	RALBP1	Q15311	655 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	ECE1	P42892	770 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	GRAP	Q13588	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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