RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407637.5

HERC3-203, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 2,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-203ENST00000407637 ATP8B1O43520 1251 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 FOXR1Q6PIV2 292 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 SPATA32Q96LK8 384 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 BICD2Q8TD16 824 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 DEPDC5O75140 1603 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 A0A087WWV3 80 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 GNAI3P08754 354 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 DEF6Q9H4E7 631 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 HYPKQ9NX55 129 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 H3BQF6 201 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 FYB1O15117 783 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 NECAB1Q8N987 351 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 CARD6Q9BX69 1037 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 DNAI1Q9UI46 699 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 CEP83Q9Y592 693 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 FAM83GA6ND36 823 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 EVCP57679 992 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 HOMER1Q86YM7 354 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 CCDC172P0C7W6 258 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 BECN2A8MW95 431 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 GSDMDP57764 484 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 IVLP07476 585 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 FBLN1P23142 703 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 DCTN1Q14203 1278 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 PGBD1Q96JS3 809 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 CAVIN2O95810 425 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 NBPF11Q86T75 865 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-203ENST00000407637 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 FANCGO15287 622 aa14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 FBLN2P98095 1184 aa14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 STX1AQ16623 288 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 ME3Q16798 604 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 FUT8Q9BYC5 575 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SGSM2O43147 1006 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 PPM1EQ8WY54 764 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 VPS18Q9P253 973 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 TPM1P09493 284 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 FBXW7Q969H0 707 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 PRAM1Q96QH2 718 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 STAP2Q9UGK3 403 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SPG7Q9UQ90 795 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 CNPY4Q8N129 248 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SMC2O95347 1197 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 TMC6Q7Z403 805 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 PPLO60437 1756 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-203ENST00000407637 F6X3S4 739 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms