RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPATCH3Q96I76 525 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DIP2AQ14689 1571 aa8.4□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RALBP1Q15311 655 aa8.4□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.4□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CERS3Q8IU89 383 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1W2PP64 1363 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM94Q12767 1356 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACEP12821 1306 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTCH1Q13635 1447 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNNI2P48788 182 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIF1Q9H611 641 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPS1P31327 1500 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SFI1A8K8P3 1242 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCER2I3L3R5 266 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSME1Q06323 249 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LYPD8Q6UX82 237 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PACS2Q86VP3 889 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMC7Q7Z402 723 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RETREG3Q86VR2 466 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ORAI2Q96SN7 254 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXO3O43524 673 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBLN1P23142 703 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NME9Q86XW9 330 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FYB1O15117 783 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MARCH6O60337 910 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FANCCQ00597 558 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ILDR2Q71H61 639 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP13Q86W25 1043 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIX5Q8N196 739 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB11FIP3O75154 756 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP2R1AP30153 589 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EML3Q32P44 896 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MSH6P52701 1360 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFHP08603 1231 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COG3Q96JB2 828 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DESI1Q6ICB0 168 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SETDB2Q96T68 719 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP7BP35670 1465 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABTB2Q8N961 1025 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYOM1P52179 1685 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIMBP2O15034 1052 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL19A1Q14993 1142 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAPN10Q9HC96 672 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPREP23469 700 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP6V1AP38606 617 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTHFSP49914 203 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEC13P55735 322 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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