RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCN1P35523 988 aa27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO6Q4KMQ2 910 aa27.78■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 PPFIA3O75145 1194 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 NSD2O96028 1365 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 HAND2P61296 217 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 NCOA7Q8NI08 942 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 MICU3Q86XE3 530 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT222Q8N1A0 295 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 EHBP1Q8NDI1 1231 aa27.77■■■□□ 2.04
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.76■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 IL16Q14005 1332 aa27.76■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 USP48Q86UV5 1035 aa27.76■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.76■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF11O15085 1522 aa27.76■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
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GNPTAB-201ENST00000299314 SDSP20132 328 aa27.76■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 UBASH3AP57075 661 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 NECAB1Q8N987 351 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 NOP2P46087 812 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAI2Q9GZS0 605 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3R4Q99570 1358 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 STAMBPO95630 424 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 IDEP14735 1019 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC5O15440 1437 aa27.75■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.74■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 TCERG1LQ5VWI1 586 aa27.74■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SYKP43405 635 aa27.74■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 HSF2BPO75031 334 aa27.74■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SKILP12757 684 aa27.74■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 N4BP3O15049 544 aa27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF5BP33176 963 aa27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 NF2P35240 595 aa27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 CETN1Q12798 172 aa27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP112Q8N8E3 955 aa27.73■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 CTNNA2P26232 953 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 TOPBP1Q92547 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD6Q6ZSS7 791 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRKQ9NRH2 765 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 ZPR1O75312 459 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 UBA7P41226 1012 aa27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 GPATCH11Q8N954 259 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM83GA6ND36 823 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM47Q96LD4 638 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO1BO43795 1136 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGD1Q96MW7 591 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.71■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 BRF1Q92994 677 aa27.7■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 SCLT1Q96NL6 688 aa27.7■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.7■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 RMND1Q9NWS8 449 aa27.7■■■□□ 2.03
GNPTAB-201ENST00000299314 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.7■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.69■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 KAT14Q9H8E8 782 aa27.69■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K1Q13233 1512 aa27.69■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAI1Q9UI46 699 aa27.69■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.69■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC1Q9NV70 894 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAGE15A4D2H0 777 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAGE8P0CG41 777 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAGE6Q86UF2 777 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CTAGE4Q8IX94 777 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNG4Q8TDN1 519 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX21Q969T3 373 aa27.68■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 PRC1O43663 620 aa27.67■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 SLF2Q8IX21 1173 aa27.67■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 ARFGAP3Q9NP61 516 aa27.67■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC27Q9C0I9 530 aa27.66■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.66■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 FSD2A1L4K1 749 aa27.66■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP63Q96MT8 703 aa27.66■■■□□ 2.02
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