RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 ERFEQ4G0M1 354 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 CNKSR1Q969H4 720 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 IL16Q14005 1332 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 COPS6Q7L5N1 327 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 LMNB1P20700 586 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 NPR1P16066 1061 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 NTSR2O95665 410 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 OLFM4Q6UX06 510 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 NYXQ9GZU5 481 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 CRY2Q49AN0 593 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 IFT57Q9NWB7 429 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 HOXB7P09629 217 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 GNAI1P63096 354 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 CRBNQ96SW2 442 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 LAMB2P55268 1798 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 SLC51AQ86UW1 340 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC6-201ENST00000243108 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 BCAR3O75815 825 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 PARP10Q53GL7 1025 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 NLRP10Q86W26 655 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 SYNE4Q8N205 404 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF428Q96B54 188 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 RRAGCQ9HB90 399 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 SNED1Q8TER0 1413 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 TCIRG1Q13488 830 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 GLTPD2A6NH11 291 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 TOMM70O94826 608 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 ALDH1B1P30837 517 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 SOGA3Q5TF21 947 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC93Q567U6 631 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 TSPYL6Q8N831 410 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 HYPKQ9NX55 129 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 TAF1P21675 1872 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC6-201ENST00000243108 POTECB2RU33 542 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 HSPA6P17066 643 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 PDE3AQ14432 1141 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 WDR90Q96KV7 1748 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 NLRP3Q96P20 1036 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 COL4A5P29400 1685 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC4O15439 1325 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 FAM89AQ96GI7 184 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC6-201ENST00000243108 COL4A1P02462 1669 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXC6-201ENST00000243108 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXC6-201ENST00000243108 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXC6-201ENST00000243108 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXC6-201ENST00000243108 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22■■□□□ 1.11
HOXC6-201ENST00000243108 PSMD1Q99460 953 aa22■■□□□ 1.11
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