RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000163394.1

Pnldc1-201, Transcript of Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pnldc1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Zbtb1Q91VL9 713 aa23.54■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa23.54■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Tmc2Q8R4P4 888 aa23.54■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Arap2Q8BZ05 1703 aa23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Rfx1P48377 963 aa23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Clca2Q8BG22 942 aa23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Top1mtQ8R4U6 593 aa23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Eya2O08575 532 aa23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Gsdma2Q32M21 443 aa23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Rad50P70388 1312 aa23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Casq1O09165 405 aa23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Chmp3Q9CQ10 224 aa23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 DbnlQ62418 436 aa23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Znf692Q3U381 531 aa23.5■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Atg9aQ68FE2 551 aa23.5■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa23.5■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Prr5lA2AVJ5 370 aa23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ms4a2P20490 235 aa23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Jarid2Q62315 1234 aa23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Dhx38Q80X98 1228 aa23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Fam102bQ8BQS4 339 aa23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ssc5dQ8BV57 1371 aa23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Cyp19a1P28649 503 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Atp6v1dP57746 247 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 EspnlQ3UYR4 1005 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Jakmip1Q8BVL9 626 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Plcd4Q8K3R3 807 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Tmem266Q8BZB3 538 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Esco1Q69Z69 843 aa23.47■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Casz1Q9CWL2 1761 aa23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Cops6O88545 324 aa23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 GptQ8QZR5 496 aa23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 LratQ9JI60 231 aa23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Eno4Q8C042 619 aa23.45■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Trim34aQ99PP6 485 aa23.45■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Trim34bJ3QNR8 485 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Atp8a2P98200 1148 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Zbtb38Q3LR78 1197 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 KinQ8K339 391 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Adam1aQ60813 791 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Miga2Q8BK03 593 aa23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Abca3Q8R420 1704 aa23.43■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Slf2Q6P9P0 1278 aa23.43■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Foxo4Q9WVH3 505 aa23.43■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 MecomP14404 1042 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Zbtb45Q52KG4 520 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ifit2Q64112 472 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Rdm1Q9CQK3 281 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ttc14Q9CSP9 761 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Mlh1Q9JK91 760 aa23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Asap2Q7SIG6 958 aa23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Bsdc1Q80Y55 427 aa23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Krt25Q8VCW2 446 aa23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Antxr1Q9CZ52 562 aa23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Vwa3bJ9JI28 736 aa23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Strn4P58404 760 aa23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 BcanQ61361 883 aa23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Filip1lQ6P6L0 1131 aa23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Tshz3Q8CGV9 1081 aa23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ccdc7Q9D541 371 aa23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Phactr2B1AVP0 632 aa23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ftl2P49945 183 aa23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Igflr1Q3U4N7 345 aa23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Fbxo3Q9DC63 480 aa23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Add2Q9QYB8 725 aa23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Cntnap1O54991 1385 aa23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 DaxxO35613 739 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Sema6bO54951 886 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Timm10P62073 90 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Cyp7a1Q64505 503 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Ubxn10Q8BG34 277 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Greb1lB9EJV3 1913 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Nphp3Q7TNH6 1325 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Lrrc43Q3V0L5 667 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Rnf20Q5DTM8 973 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 SowahdQ8BY98 327 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 MypopQ8R4U1 393 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Bmp2kQ91Z96 1138 aa23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Bicdl1A0JNT9 577 aa23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1-201ENSMUST00000163394 Smarcc1P97496 1104 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.2 ms